尽管溃疡性结肠炎属于我国中医学的“泄泻”、“肠澼”、“久痢”、“滞下”、“脏毒”、“血痢”等范畴，而且其病理变化和临床表现与细菌性痢疾非常相似，在我国菌痢发病率较高，许多溃疡性结肠炎患者开始时常常被误诊为菌痢，在诊断为溃疡性结肠炎的病例中，有菌痢既往史者为数不少，因此，容易误诊。但根据病史、大便镜检及培养可以鉴别。