引起性交疼痛的原因很多，生殖器官和泌尿系统的各种疾病，先天畸形等都可能引起。较典型的病变是接近阴道后穹窿的宫底韧带上有内膜异位结节，盆腔内炎症使腹膜脏器粘连，阴茎插入时撞击宫颈，引起腹膜振动而牵动脏器产生疼痛。阴道润滑不足时可以发生疼痛，女性盆腔脏器炎症粘连、局部疤痕、宫颈炎、子宫内膜炎、卵巢的囊肿或肿瘤、阴道痉挛等都会产生性交疼痛。